Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1B3P54709 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1B3P54709 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms