Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOSBP53539 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOSBP53539 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOSBP53539 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOSBP53539 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOSBP53539 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOSBP53539 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOSBP53539 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOSBP53539 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms