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Protein–RNA interactions for Protein: P53202
CUL3, Cullin-3, yeast
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744 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CUL3
P53202
YAR029W
YAR029W
225 nt
2.32
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
RPL26A
YLR344W
384 nt
2.32
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
YMR324C
YMR324C
243 nt
2.32
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
NUP120
YKL057C
3114 nt
2.32
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
CDC24
YAL041W
2565 nt
2.32
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
PCF11
YDR228C
1881 nt
2.31
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
YLR458W
YLR458W
381 nt
2.31
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
RPS17A
YML024W
411 nt
2.31
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
WIP1
YDR374W-A
270 nt
2.3
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
PEX4
YGR133W
552 nt
2.3
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
YJL052C-A
YJL052C-A
120 nt
2.3
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
IRC23
YOR044W
474 nt
2.3
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
SIR4
YDR227W
4077 nt
2.3
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
YJL070C
YJL070C
2667 nt
2.29
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
MSS11
YMR164C
2277 nt
2.29
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
snR79
snR79
84 nt
2.29
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
TMA22
YJR014W
597 nt
2.29
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
RPL9B
YNL067W
576 nt
2.29
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
DAD3
YBR233W-A
285 nt
2.29
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
IRC10
YOL015W
1761 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
BNI1
YNL271C
5862 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
snR8
snR8
190 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
EMP24
YGL200C
612 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
SHE2
YKL130C
741 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
YAL059C-A
YAL059C-A
423 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
ISF1
YMR081C
1017 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
YBL073W
YBL073W
312 nt
2.28
□□□□□ -2.04
CUL3
P53202
STE5
YDR103W
2754 nt
2.27
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
REV3
YPL167C
4515 nt
2.27
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
RAM2
YKL019W
951 nt
2.27
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
HCH1
YNL281W
462 nt
2.27
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YPR146C
YPR146C
330 nt
2.27
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YBP1
YBR216C
2025 nt
2.27
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
AFI1
YOR129C
2682 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
KOG1
YHR186C
4674 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
UBP11
YKR098C
2154 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
TOF1
YNL273W
3717 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
HMRA2
YCR096C
360 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
FMP16
YDR070C
282 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
LSM7
YNL147W
348 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
MGR1
YCL044C
1254 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
NAN1
YPL126W
2691 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
DNF1
YER166W
4716 nt
2.26
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
GYP5
YPL249C
2685 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
PTC5
YOR090C
1719 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
MET18
YIL128W
3099 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
IPT1
YDR072C
1584 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
LSO2
YGR169C-A
279 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YPL229W
YPL229W
621 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
CSF1
YLR087C
8877 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
SAP185
YJL098W
3177 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
RRP6
YOR001W
2202 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
UBR1
YGR184C
5853 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
OST1
YJL002C
1431 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
UFD4
YKL010C
4452 nt
2.25
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
DAD4
YDR320C-A
219 nt
2.24
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YMR290W-A
YMR290W-A
348 nt
2.24
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YBR121C-A
YBR121C-A
159 nt
2.24
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
BRE1
YDL074C
2103 nt
2.24
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
GUP1
YGL084C
1683 nt
2.24
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
STH1
YIL126W
4080 nt
2.24
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
UBP15
YMR304W
3693 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
REV1
YOR346W
2958 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
RRP12
YPL012W
3687 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YDL011C
YDL011C
324 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YER121W
YER121W
345 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YKL165C-A
YKL165C-A
234 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
RPS18B
YML026C
441 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
VMA9
YCL005W-A
222 nt
2.23
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
NOT5
YPR072W
1683 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YHR180W-A
YHR180W-A
183 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
RPL39
YJL189W
156 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
MF(ALPHA)1
YPL187W
498 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
TAE2
YPL009C
3117 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
IST2
YBR086C
2841 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
MPH1
YIR002C
2982 nt
2.22
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
YFR016C
YFR016C
3702 nt
2.21
□□□□□ -2.05
CUL3
P53202
RAV1
YJR033C
4074 nt
2.21
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YDR183C-A
YDR183C-A
258 nt
2.21
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
RTC6
YPL183W-A
282 nt
2.21
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
NCL1
YBL024W
2055 nt
2.21
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
PRE4
YFR050C
801 nt
2.2
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YHR063W-A
YHR063W-A
336 nt
2.2
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
RTT107
YHR154W
3213 nt
2.2
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
CDC53
YDL132W
2448 nt
2.2
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YOL098C
YOL098C
3114 nt
2.19
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
CSN9
YDR179C
489 nt
2.19
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
QCR7
YDR529C
384 nt
2.19
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YFL063W
YFL063W
456 nt
2.19
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
2.19
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
FCF2
YLR051C
654 nt
2.19
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
KAR3
YPR141C
2190 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YDL025W-A
YDL025W-A
105 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YGL014C-A
YGL014C-A
162 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
YJL020W-A
YJL020W-A
258 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
LCL2
YLR104W
396 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
GRX8
YLR364W
330 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
RKM1
YPL208W
1752 nt
2.18
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
IRC8
YJL051W
2469 nt
2.17
□□□□□ -2.06
CUL3
P53202
BFA1
YJR053W
1725 nt
2.17
□□□□□ -2.06
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