Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LBX1P52954 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBX1P52954 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBX1P52954 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBX1P52954 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBX1P52954 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBX1P52954 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBX1P52954 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms