Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP98P52948 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP98P52948 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP98P52948 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms