Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NESP48681 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NESP48681 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NESP48681 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NESP48681 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NESP48681 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NESP48681 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NESP48681 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NESP48681 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
NESP48681 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
NESP48681 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NESP48681 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NESP48681 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NESP48681 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NESP48681 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NESP48681 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NESP48681 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms