Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms