Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSN1S1P47710 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms