Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GALR1P47211 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GALR1P47211 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GALR1P47211 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GALR1P47211 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GALR1P47211 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GALR1P47211 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms