Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 SGM1YJR134C 2124 nt2.27□□□□□ -2.05
VBA2P38358 OSW7YFR039C 1533 nt2.27□□□□□ -2.05
VBA2P38358 AFI1YOR129C 2682 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 KAP123YER110C 3342 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 KRE33YNL132W 3171 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 SRB8YCR081W 4284 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 SWA2YDR320C 2007 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 HYP2YEL034W 474 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 EMC6YLL014W 327 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 LCL1YPL056C 306 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 GIS1YDR096W 2685 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YNL018CYNL018C 1839 nt2.26□□□□□ -2.05
VBA2P38358 DNA2YHR164C 4569 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 TOF2YKR010C 2316 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YEL043WYEL043W 2871 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 TAR1YLR154W-C 375 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YBR224WYBR224W 516 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 SPO22YIL073C 2928 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 KEL2YGR238C 2649 nt2.25□□□□□ -2.05
VBA2P38358 RIC1YLR039C 3171 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YMR320WYMR320W 306 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 JIP5YPR169W 1479 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 PHO2YDL106C 1680 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 PDR11YIL013C 4236 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 SKP2YNL311C 2292 nt2.24□□□□□ -2.05
VBA2P38358 TMN3YER113C 2121 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 RSE1YML049C 4086 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 GCN4YEL009C 846 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YHL041WYHL041W 450 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 VMA9YCL005W-A 222 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YLR149CYLR149C 2193 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 IRA2YOL081W 9240 nt2.23□□□□□ -2.05
VBA2P38358 CDC27YBL084C 2277 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 EDS1YBR033W 2760 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 SIR3YLR442C 2937 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 CRM1YGR218W 3255 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 GUP1YGL084C 1683 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 STB4YMR019W 2850 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YIL059CYIL059C 366 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 RPA34YJL148W 702 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 PEP3YLR148W 2757 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 DFG16YOR030W 1860 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 ALK2YBL009W 2031 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 VMR1YHL035C 4779 nt2.22□□□□□ -2.05
VBA2P38358 YEL057CYEL057C 702 nt2.21□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SAR1YPL218W 573 nt2.21□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YBR184WYBR184W 1572 nt2.21□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SMY1YKL079W 1971 nt2.21□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SEF1YBL066C 3447 nt2.21□□□□□ -2.06
VBA2P38358 OSH6YKR003W 1347 nt2.2□□□□□ -2.06
VBA2P38358 snR8snR8 190 nt2.2□□□□□ -2.06
VBA2P38358 HTB2YBL002W 396 nt2.2□□□□□ -2.06
VBA2P38358 DAD3YBR233W-A 285 nt2.2□□□□□ -2.06
VBA2P38358 CDC53YDL132W 2448 nt2.2□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SVL3YPL032C 2478 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SNF5YBR289W 2718 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 VPS13YLL040C 9435 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 HMRA2YCR096C 360 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YDR048CYDR048C 315 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YGL149WYGL149W 306 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 PDR3YBL005W 2931 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 TOR1YJR066W 7413 nt2.19□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SCH9YHR205W 2475 nt2.18□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SPF1YEL031W 3648 nt2.18□□□□□ -2.06
VBA2P38358 PEX8YGR077C 1770 nt2.18□□□□□ -2.06
VBA2P38358 PRE4YFR050C 801 nt2.18□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.18□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YEF3YLR249W 3135 nt2.18□□□□□ -2.06
VBA2P38358 UBR1YGR184C 5853 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 MNL2YLR057W 2550 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SCD5YOR329C 2619 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 snR70snR70 164 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 KTI11YBL071W-A 249 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 NEW1YPL226W 3591 nt2.17□□□□□ -2.06
VBA2P38358 PHO91YNR013C 2685 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 MGM1YOR211C 2646 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SGS1YMR190C 4344 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 MRP10YDL045W-A 288 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 YBL083CYBL083C 426 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 HHT1YBR010W 411 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 snR51snR51 107 nt2.16□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SET2YJL168C 2202 nt2.15□□□□□ -2.06
VBA2P38358 SEC16YPL085W 6588 nt2.15□□□□□ -2.06
VBA2P38358 STE11YLR362W 2154 nt2.15□□□□□ -2.07
VBA2P38358 HTL1YCR020W-B 237 nt2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.5 ms