Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBRP36941 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBRP36941 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBRP36941 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBRP36941 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBRP36941 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms