Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms