Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG3P32926 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSG3P32926 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG3P32926 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms