Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRABP1P29762 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms