Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms