Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRB3P28472 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms