Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms