Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMBRP28336 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMBRP28336 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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