Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLNP26678 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLNP26678 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLNP26678 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PLNP26678 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms