Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN1P23435 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms