Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD33P20138 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD33P20138 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD33P20138 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms