Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMY2BP19961 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms