Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A1P19634 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A1P19634 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms