Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms