Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGAMP11215 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGAMP11215 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGAMP11215 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGAMP11215 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGAMP11215 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGAMP11215 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAMP11215 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms