Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms