Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
POLA1P09884 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLA1P09884 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLA1P09884 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLA1P09884 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLA1P09884 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLA1P09884 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLA1P09884 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLA1P09884 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLA1P09884 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
POLA1P09884 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
POLA1P09884 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLA1P09884 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLA1P09884 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms