Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIL1P09327 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIL1P09327 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VIL1P09327 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIL1P09327 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms