Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFMP07197 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEFMP07197 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFMP07197 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFMP07197 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFMP07197 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms