Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DOAP06340 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms