Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGAP02671 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGAP02671 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGAP02671 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGAP02671 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGAP02671 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGAP02671 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms