Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1RP00736 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1RP00736 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1RP00736 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1RP00736 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1RP00736 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1RP00736 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms