Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX3O75364 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX3O75364 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX3O75364 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX3O75364 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms