Protein–RNA interactions for Protein: O60499

STX10, Syntaxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX10O60499 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX10O60499 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX10O60499 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX10O60499 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX10O60499 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX10O60499 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX10O60499 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX10O60499 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX10O60499 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STX10O60499 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms