Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH6O60337 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms