Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMINO43313 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMINO43313 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATMINO43313 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMINO43313 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMINO43313 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMINO43313 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMINO43313 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMINO43313 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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