Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A1O14983 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A1O14983 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms