Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3AO14802 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3AO14802 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms