Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP2O14595 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP2O14595 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms