Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C1W4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C1W4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1W4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1W4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1W4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1W4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms