Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms