Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms