Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTAGE9A4FU28 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAGE9A4FU28 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms