Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms