Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AL138831.3-201ENST00000623656 1458 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SKP79-201ENST00000363373 336 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 IGLV3-1-201ENST00000390319 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC013402.3-201ENST00000438566 451 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MICC-201ENST00000445710 1055 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL449P-201ENST00000464937 286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPL4P1-201ENST00000496596 1278 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AF186996.2-201ENST00000508347 907 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RBM48P1-201ENST00000509661 1102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC008591.1-202ENST00000515569 462 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC138356.2-201ENST00000521192 667 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 H2AFZP4-201ENST00000534148 377 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC007907.1-201ENST00000557953 451 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC013652.1-206ENST00000558277 789 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC006504.5-211ENST00000588636 576 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC003098.1-201ENST00000591540 494 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OR7E16P-201ENST00000592975 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPL12P41-201ENST00000599500 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL355989.2-201ENST00000603304 512 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 uc_338.23-201ENST00000614169 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.155-201ENST00000616367 282 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.62-201ENST00000619972 268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TP63-211ENST00000449992 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 AC022486.1-201ENST00000510613 1483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 DCLRE1C-205ENST00000378249 2246 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 AC121338.1-201ENST00000380601 1287 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 IGLV6-57-201ENST00000390285 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FTH1P10-201ENST00000401830 930 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC009319.1-201ENST00000411493 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZRANB2-AS2-203ENST00000415780 249 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CYP4F62P-201ENST00000417310 524 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC103563.4-201ENST00000454384 368 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC092610.1-201ENST00000454916 373 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL754P-201ENST00000470784 266 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPL5P29-201ENST00000482972 894 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL800P-201ENST00000484823 280 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC106795.1-207ENST00000507037 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SRD5A3-AS1-202ENST00000510637 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC106794.2-201ENST00000513713 632 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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