Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 RNF212B-202ENST00000399910 1670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC02059-202ENST00000506471 2094 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC008514.2-201ENST00000522096 1337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC135731.2-201ENST00000603029 2098 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SIRPD-202ENST00000381623 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SMARCA2-202ENST00000324954 1781 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RBMS2-204ENST00000550726 1452 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FLT1-206ENST00000615611 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GSTA5-202ENST00000370989 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 INIP-201ENST00000374234 713 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SNORA7.3-201ENST00000384186 139 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 Z93930.2-202ENST00000418292 208 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC01687-202ENST00000419467 465 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC119428.1-201ENST00000429099 383 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AKR1B1P1-201ENST00000429105 956 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC084809.1-201ENST00000435733 591 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LMNTD1-203ENST00000445693 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC073583.1-201ENST00000447553 400 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC02543-201ENST00000451285 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC01647-201ENST00000453135 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC004917.1-202ENST00000475791 760 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CAMTA1-210ENST00000476864 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC055758.2-202ENST00000482351 624 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC100849.1-203ENST00000518417 723 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SAP30L-AS1-204ENST00000524264 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLA-223ENST00000524345 1003 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LMO3-222ENST00000540445 906 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GABARAPL1-214ENST00000545047 559 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 C12orf73-203ENST00000546540 590 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TUBA1C-204ENST00000549183 696 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CDRT7-201ENST00000568256 767 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC011465.1-201ENST00000599092 328 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC011894.1-201ENST00000603255 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SRGAP2D-201ENST00000605551 1021 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC093726.2-201ENST00000609134 679 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL391987.5-201ENST00000618472 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL121785.1-201ENST00000624745 708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CCDC163-207ENST00000629482 953 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GRXCR2-202ENST00000639411 837 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FGG-203ENST00000404648 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PATE2-201ENST00000358524 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 KCNMB2-207ENST00000452583 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms