Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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