Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms