Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N7

ROBO1, Roundabout homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1Q9Y6N7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ROBO1Q9Y6N7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO1Q9Y6N7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms