Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1Q9Y3T6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms